C'est l'hiver et le Gruffalo a formellement interdit à son fils de se rendre dans les bois. Les arbres sombres abritent la créature que tous redoutent : la Grande Méchante Souris. Avec sa queue à écailles, ses yeux de feu et ses moustaches dures comme l'acier, elle est réputée pour être redoutable et cruelle. Mais le petit Gruffalo n'a que faire des avertissements de son père. Il décide de s'engouffrer dans l'obscurité de la forêt et de se lancer à la poursuite de la Grande Méchante Souris...
